李自成的尸身被运进了北京城，然后送到了紫禁城承天门，供太子朱慈烺以及满朝文武查看贼酋的尸身。
“果然是李自成，这名贼酋终于死了。”
朱慈烺确认棺椁中的死者就是李自成后感慨不已，立即命礼部修书飞报南京，向大明天子朱由检禀报这个好消息。
虽然都晓得吴三桂的“迷路之说”不太可信，但他冒雨撤兵也是事实，在下着大雨的黑夜走错路也不是不成能。
更何况还有射杀李自成的惊天之功，朱慈烺也不好追究吴三桂的责任，便改封他为高邮侯，将他的家乡江苏高邮册封为他的食邑之地。
吴三桂虽然没有被授予国公，但究竟有了封邑，成为了进京勤王的最大赢家，在受封之后心满意足的带领麾下兵马朝山海关返程。
诸葛亮又向朱慈烺进言：“朝廷应当趁着李自成死后叛军群龙无首，颁布诏书赦免其他的闯军将士，只要主动投降朝廷者便既往不咎，并将李自成下葬。”
朱慈烺在早朝上力排寡议，按照诸葛亮的建议下葬李自成，颁布诏书招降各路闯军残部，只要主动放下武器投降，便不再追究反叛之罪。
同时，朱慈烺又多次召睹闯将刘芳亮，晓之以情动之以理，终于让刘芳亮决定投降明朝，并愿意主动招降各路闯军残部。
刘芳亮来到李自成的坟前吊唁完毕，匹马离开北京前往各地游说闯军残部归顺朝廷，共同剿灭关外的满清政权，还公民一个太平盛世。
朝中不少大臣纷纷向朱慈烺进谏道：“殿下不成放刘芳亮离开，他脱死后必然食言。”
朱慈烺大笑道：“用人不疑疑人不用，李自成都死了，本宫难道还怕一个小小的刘芳亮么？”
就在北京朝廷礼葬李自成的时候，多尔衮果然带领十万清军偷袭山海关，很快杀的明军伤亡惨重，就算有胡国柱的五千援军支援也是杯水车薪。
双方激战了一天一夜，守关主将蓟州总兵韩辅国战死城头，明军阵亡一万五千余人。
就在山海关眼睹即将失守之际，突然有一支万余人的精锐骑兵从清军背后杀出，为首大将正是星夜驰援的霍去病。
原来是霍去病途经遵化府的时候念到清军连续两次从这里进关直捣华夏，何不以其人之道还治其人之身？
于是霍去病果断下令全军改道北上直奔紧亭关，花了一天的时间穿过紧亭关，顺着塞外的道路悄悄摸向山海关。
霍去病一边催促麾下骑兵全力疾行，一边派出斥候密查山海关的情况，得知清军果然悄无声息的兵临山海关城下。
“哈哈……这就叫做螳螂捕蝉黄雀在后，将士们跟着我偷袭清军的屁股！”
这支骑兵花了两天的时间抵达了山海关北方，趁着清军猛攻山海关之际出其不意的杀了出来，以猛虎下山之势冲向清军的背部。
清军猝不及防，被杀得人仰马翻，在明军铁骑几个冲锋之下阵亡了两千余人，阵脚大乱，士气大为受挫。
多尔衮无可怎样，只能废弃了即将拿下的山海关，命悍将鳌拜、拖雷等人分兵围堵这支孤军深入的明军，企图将之一网打尽。
但霍去病并不与清军纠缠，睹清军主力杀了过来，连忙率部原路向西撤退，远远的用弓箭、火铳骚扰清军。
多尔衮勃然大怒，号令多铎带着鳌拜、拖雷带领两万骑兵贫追这支明军，就算追到沙漠里，也要把他们全部消灭。
霍去病率部打打停停，一路骚扰叱骂，引诱清军追了三百里路，直到留下三千伏兵的阎王谷，这才下令全军列阵堵住出口。
“伏兵何在？”
看到清军追进了山谷，霍去病腰间佩剑出鞘，高声下令伏兵出击。
一刹那山谷里杀声震天，山谷两侧滚石擂木滔滔而下，箭矢如雨，子弹如蝗，杀得清军人仰马翻，死伤不成胜数。
多铎气急败坏的下令撤退，战后清点人数，竟然在山谷里阵亡了三千余人，不由得急火攻心，气得差点跌下马来。
因为受到霍去病骑兵的牵制，清军对山海关的攻势减弱了许多，明将胡国柱重整旗鼓，带领两万明军背隅顽抗，借助山海关的险要死守关卡。
多尔衮也晓得再耽误下去就失去了破关的机遇，亲自策马督战，两军再次激战了两天两夜，俱都付出了不小的伤亡。
就在山海关岌岌可危的时候，吴三桂麾下大将马宝带领的五千先锋部队抵达关内，迅速投入防御，让清军最为凶猛地此次进攻铩羽而归，士气大为受挫。
次日，吴三桂带领的主力抵达山海关，使得防御力量大幅加强，多尔衮晓得破关无望，只能遗憾的带领清兵撤退到宁远一线。
朱由检接到李自成阵亡的消息后兴奋地痛哭流涕，带领南京的文武大臣于太明祭奠明朝列祖列宗，并降诏大赦世界。
左良玉带领十五人马抵达北京附近后才晓得闯军曾经溃败，自己白跑了一趟，本计划撤兵回襄阳，却接到了加封他为宁南侯的诏书，并要求他进京谢恩。
左良玉原来对于是否进京心存疑虑，但因为前来颁布诏书的人是他的恩师侯恂，权衡再三，便跟着侯恂进了北京。
朱慈烺亲自设宴款待左良玉，除了册封他为宁南侯之外，还加封太子太保、兵部尚书的头衔，赐府邸一座，婢子三十人，侍卫三百人。
这三百侍卫就把左良玉软禁在了北京城里的私宅内，再也无法出门。
胜利软禁了左良玉，朱慈烺命诸葛亮前往接掌这支兵马，戚继光、罗成、林冲、花荣、潘风、邢道荣作为部将随同协助。
诸葛亮进了左良玉大营后，软硬兼施，靠着罗成、林冲等人的悍勇，胜利夺权，又裁员五万人，最后精简成了一支十万人的精锐部队。
经过刘芳亮的劝降，以及朝廷的大力招抚，在接下来的三个月之内，逃集往各处的闯军纷纷归顺朝廷，累计招募到十五万人，由戚继光作为主将统率。
七月初一，朱慈烺迎娶张星彩，并诏告世界，册封她为太子妃。
经过两年的改革，在朱慈烺的带领下大明朝廷革除弊端，振兴军事，胜利的控制住了瘟疫，并向商人征税，大幅改善了明朝的经济。
次年，朱由检宣布退位担负太上皇，朱慈烺于北京紫禁城皇极殿登基称帝，改元乾顺。
朱慈烺登基后册封张星彩为皇后、魏乔为贵妃、林黛玉为德嫔，并尊张嫣、周玉凤为东西太后。
随着国内政局的逐渐不乱，赵云从南京动身，带领十万明军溯江而上，前往湖北讨伐张献忠，与左梦庚麾下的明军摆布夹攻，激战半年，大败张献忠。
张献忠在逃亡途中被部下枭首杀害，至此轰轰烈烈的明末农民起义宣布完毕。
经过两年的安稳发展，明军实力大幅加强，朱慈烺命诸葛亮率三十万人为中军，霍去病率两十万人为右翼，戚继光率两十万人为左翼，总计七十万大军越过长城，讨伐清朝……
三年后，辽东平定，多尔衮身死，孝庄太后与顺治天子被押解北京，满清灭亡，世界太平。
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