经过一连串的调查和冒险，艾伦和神秘女子胜利将生化武器从阳影构造手中夺回。他们晓得这仅仅是揭开阳影构造真相的第一步，接下来还有许多工作要做。在这个进程中，艾伦和神秘女子建立起了深厚的信任，她告诉艾伦自己的名字叫苏菲。
回到艾伦的调查局，两人决定阐发夺回的生化武器，以及之前从阳影构造诡秘基地下载到的资料。艾伦开端对这些资料进行详细的研究，试图找出阳影构造的核心成员。他发明阳影构造现实上是一个庞大的犯罪网络，其势力范围遍及全球。构造内部有严密的等级制度，核心成员异常隐秘，即使是普通成员也很少晓得他们的存在。
艾伦不禁为阳影构造的庞大规模和严密构造而感到震惊。他晓得，要念彻底摧毁这个犯罪集团，必须从顶层入手，找出那些操纵着阳影构造的幕后黑手。苏菲也意识到了这个问题的严重性，她决定帮忙艾伦一起追查这些核心成员。
经过数日的搜寻和阐发，艾伦发明了一个关键线索。在阳影构造的一次诡秘交易中，他们找到了一名慌张的交易人，这个人仿佛对阳影构造的核心成员有所晓得。艾伦和苏菲决定跟踪这名交易人，盼望能从他那里获得更多信息。
他们小心翼翼地跟踪着这名交易人，数日后，终于在一家豪华酒店的包厢里发明了他。艾伦和苏菲悄悄潜入包厢，趁交易人不备制服了他。在审讯中，这名交易人终于流露出了一些关于阳影构造核心成员的信息。他透露，阳影构造的头子，也就是阳影领主，现实上是一位名叫杰克逊的富商。这个人皮相上是一名正经的商界人士，但现实上却操控着全球最大的犯罪网络。杰克逊一直在暗中操纵着阳影构造，不但与紫云藤有关，还涉及到其他一系列犯罪活动，包括犯警武器交易、绑架、贩毒等。艾伦和苏菲晓得，为了彻底摧毁阳影构造，他们必须逮捕杰克逊。
为了确保行动的胜利，艾伦和苏菲精心筹谋了一个计划。他们先通过一系列线人和调查，找到了杰克逊的住所。之后，两人在一晚深夜悄悄潜入杰克逊的别墅。在别墅中，他们发明了一个躲藏的地下室。地下室里，杰克逊保存了大量关于阳影构造的文件和资料，证实了他就是阳影领主的身份。此外，他们还发明了一个惊人的诡秘：杰克逊正策一律场更加恐怖的袭击，目标是全球范围内的慌张城市。
艾伦和苏菲立即行动，决定在杰克逊实施这场恐怖袭击之前将他绳之以法。在一场激战中，艾伦和苏菲胜利将杰克逊制服，并将他交给了警方。警方对杰克逊进行了审讯，从他口中获得了大量关于阳影构造的信息。在这些信息的指引下，警方展开了一场全球性的行动，胜利摧毁了阳影构造的许多慌张基地，逮捕了大量核心成员。
在此期间，艾伦和苏菲不息支集其他线索，试图理清案情。他们发明杰克逊的手下还有一个密谋，那就是应用紫云藤的毒性制造出一种新型生化武器，用于全球范围内的恐怖袭击。通过艾伦和苏菲的努力，这一阳谋终被粉碎，世界恢复了战争。
阳影构造的覆灭和杰克逊的逮捕，让世界各地对艾伦和苏菲充满了敬意。他们的调查局也因此声名大噪，受到了广泛的关注。然而，艾伦和苏菲并未因此紧懈。他们深知世界上的恶行仍然存在，暗夜调查局的使命仍需继续。两人决定继续携手合作，一起追查更多的恶行案件，将那些躲藏在黑暗中的罪犯绳之以法。
在这个进程中，艾伦和苏菲建立起了更加深厚的感情。苏菲透露，她之所以选择插足暗夜调查局，是因为她的家人曾遭受过阳影构造的迫害。她盼望通过自己的努力，为家人讨回公道。艾伦深受冲动，两人的关系变得更加亲密。
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